以生物資訊方法建立疾病調控網路－阿茲海默症為例

In Silico Disease Regulatory Network construction-Alzheimer's Disease

廖晃聖 ； 吳家樂

《2008資通技術管理與應用會議》 2008 (2008/12) Pp. 57-64

摘要

阿茲海默症(Alzheimer''''s disease, AD)，它是因為神經退化，而導致人類記憶逐漸喪失，和某些本能的喪失。本研究論文以阿茲海默症為例，目的在篩選出與阿茲海默症相關的轉錄因子，並建立其蛋白質與蛋白質相互作用網路及基因調控網路。 本研究中應用了NCBI資料庫，收集與AD相關的蛋白質，並且利用了數個蛋白質資料庫篩選出轉錄因子。與AD相關的轉錄因子資料篩選，則是透過HPRD和Gene Ontology基因表達的查詢，並且進一步利用NCBI GEO profile來檢視所找出來的轉錄因子，在79個組織中表現。由於轉錄因子的突變常導致與之作用的蛋白質或其調控的下游基因發生改變，形成疾病。本研究共找到五個AD的轉錄因子及十個與AD相關的蛋白質，其中的四個在現有文獻中已有記載。此外共找到17個AD轉錄因子調控的下游基因。這一個轉錄因子相互作用網路及其調控的基因網路，可作為研究AD的模型。本研究成果網頁的網址如下：http://210.70.82.82/ADwebsite/。

關鍵字

阿茲海默症 ； 神經退化 ； 轉錄因子 ； 基因表現 ； 蛋白質與蛋白質相互作用

並列摘要

無資料

並列關鍵字

Alzheimer's disease ； neurodegenerative disorders ； Transcription factor ； gene expression ； protein-protein interaction