日本漢方醫學家自十六世紀中葉以後,與來自葡萄牙、荷蘭的解剖學、化學等為基礎的西方外科醫學接觸,而出現多數《南蠻阿蘭陀流膏藥拔粹》等日文編著西方醫藥書。雖然,漢方醫藥學也受中國考證學的影響,發展獨自中國醫藥學注解、啟蒙醫學、養生、鍼灸、本草、博物等領域學問,西方醫藥學仍成為日本醫藥界的主流,多數漢方醫藥、經史等舊籍被廢棄。清末文獻考證學家楊守敬,在此情況下蒐集到中國失傳之善本秘籍,包括醫藥書籍及其研究資料。
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