茭白與黑穗菌間是一種共生的關係,黑穗菌需要植物製造的養分,但也會釋出以細胞分裂素為主的生長激素,讓茭白莖部膨大成為具經濟價值的蔬菜,因此共生狀態下植株與真菌的相對平衡是非常重要的,因為生育過於強健的植株,黑穗菌菌絲無法侵入,故無法刺激莖基部膨大者,會導致雄株的產生。而當植株生育、分蘗停滯,黑穗菌的菌絲潛育期縮短,黑穗菌產生大量孢子,形成黑棕色的冬孢子腔,同時因賣相不好,致失去商品價值,也就是俗稱的黑心或灰茭。另外在台灣所栽培的茭白品系中,利用RAPD分析植株、嫩莖及黑穗菌之DNA後,發現不同品種的植株遺傳差異相當微小,反而是黑穗菌的遺傳差異非常大,因此未來是否有可能以篩選黑穗菌的品種,並接種至茭白後即可育成理想的茭白品種,仍可進一步研究。