菌根菌(mycorrhizal fungi)為普遍存在於土壤中之有益真菌,能與地球上大多數植物根部共生,其結合體稱為「菌根」。其根外菌絲穿越根圈營養耗盡區,可幫助植物吸收更多之土壤養分,例如磷肥、氮肥、微量元素、水分,並增進植物對乾旱、鹽害與病蟲害之忍受力,進而促進植物的生育及產量。近年來,菌根在被重金屬或多環芳香烴(Polycyclic aromatic hydrocarbons)等污染土壤之植物復育工作,亦扮演了重要的角色。本研究室以木瓜、釋迦、番石榴、紅豆、洋蔥、苦瓜、胡瓜、一串紅、矮牽牛、熱帶球根花卉與文心蘭等作物接種菌根菌,已證實可被菌根菌感染而促進生長及產量;增進紅豆與木瓜植株之耐旱性,提昇彩色海芋耐軟腐病之能力。已經篩選適合之菌種與接種方法,推廣應用於木瓜、釋迦、苦瓜與胡瓜等產業。由於囊叢枝菌根菌(arbuscular mycorrbizal fungi;AMF)為絕對共生菌無法純粹培養,傳統砂耕法生產之接種源有重量與體積龐大、攜取不便、可能帶有病原菌以及孢子密度偏低而品質不佳等缺點。以氣霧栽培技術生產接種源,可降低上述缺點而獲得高產量與品質之產品。