Polya 計數定理在系統生物學研究的一個應用

廖家宏

指導教授 ： 許文郁

國立清華大學/理學院/統計學研究所/碩士(2010年)

https://doi.org/10.6843/NTHU.2010.00065

摘要

近年來，生物體的研究發展，已經從最基本的基因定序解碼，進一步的走向了解DNA、RNA和蛋白質之間的相互作用影響，也就是大家常聽到的系統生物學。系統生物學就是將DNA、RNA和蛋白質三者彼此之間的交互作用等資訊加以整合，並運用這些資料去建立數學計量模型，以期能掌握所有生物基因與組織間的關係及運作。生物網路相當複雜，彼此之間的可能組合個數也很多種，我們利用組合數學中的波利亞(Polya)計數定理，可以準確計算出多節點網路的所有可能組合個數，並研究那些生物網路中常見的模體其背後所隱藏的優勢，為何能在經過數十億年的不斷進化突變過程中，還依然能夠大量的存在生物網路中。

關鍵字

系統生物學 ； 網路模體

並列摘要

無資料

並列關鍵字

Polya ； motif ； FFL ； SIM ； DOR

參考文獻

Alon,U.(2003).Biological networks: the tinkerer as an engineer. Science,301:1866-1867.

Babu,M.M.,Luscombe, N.M.,Aravind L.,Gerstein M., and Teichmann,S.A.(2004). Structure and evolution of transcriptional regulation networks. Curr.Opin.Struct.Biol.14:283-291.

Basu,S.,Mehreja,R.,Thiberge,S.,Chen,M.T., and Weiss,R.(2004). Spatiotemporal control of gene expression with pulse-generatiog networks. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,101:6355-6360.

Berg,J. and Lassig,M.(2004) Local graph alignment and motif search in biological networks. Proc.Nati.Acad.Sci.U.S.A.,101:14689-94.

Conant,G.C. and Wagner,A.(2003). Convergent evolution of gene circuits. Nat.Genet.,34:264-266.