The Tri-functional Histidine Biosynthesis Gene (his) in Wheat Stagonospora Nodorum Blotch Pathogen, Phaeosphaeria nodorum

小麥葉枯病菌(Phaeosphaeria nodorum)的三功能－組氨酸生合成基因

Arkadiusz Malkus ； 鍾光仁(Kuang-Ren Chung) ； 張宗仁(Chung-Jan Chang) ； 翁溥(Peter P. Ueng)

《植物病理學會刊》 15卷1期 (2006/03) Pp. 55-61

https://doi.org/10.6649/PPB.200603_15(1).0006

摘要

本研究利用「降溫式(step down)」聚合酶連鎖反應(PCR)技術山小麥葉桔病菌(Phaeosphaeria nodorum)的基因組核酸中取得組氨酸生合成基因(his)序列。此his基因片段長度為2700 bp，包含二個外顯子(exon)及一個51-bp長的內含子(intron)，這二個外顯子編碼(encode)了一個含881個氨基酸的完整蛋白質。如同其他絲狀子囊菌的組氨酸合成蛋白，小麥葉枯病菌his，基因的推演(deduced)蛋白質中包含三個具生合成活性的保守性區域(consorved domain) ：磷酸核糖基－腺苷單磷酸環化水解酶(phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase; PRA-CH; EC 3.5.4.19)，磷酸核糖基－腺苷三磷酸焦磷酸水解酶(phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase: PRA-PH; EC 3.6.1.3.1)，與組氨酸脫氫酶(histidinol dehydrogenase; HDH; EC 1.1.1.23)。文中也將討論此三功能－組氨酸生合成蛋白與其受質和鋅離子的結合位置。

關鍵字

小麥葉枯病菌 ； 組氨酸脫氫酶 ； 磷酸核糖基－腺苷三磷酸焦磷酸水解酶 ； 磷酸核糖基－腺啓單磷酸環化水解酶

並列摘要

The histidine biosynthesis gene (his) sequence was obtained from wheat-biotype Phaeosphaeria nodorum genomic DNA using a ”step down” PCR amplification technique. The 2700-bp his gene fragment contained two exons and a 51-bp intron. The two exons of this gene encoded a complete 881-amino acid protein. Like the histidine synthesis proteins in other filamentous ascomycetes, the deduced protein contained the conserved domains for three biosynthetic activities: phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase (PRA-CH; EC 3.5.4.19), phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase (PRA-PH; EC 3.6.1.31), and histidinol dehydrogenase (HDH; EC 1.1.1.23). The substrate and zinc ion binding location in this tri-functional histidine biosynthesis protein is discussed.

並列關鍵字

histidinol dehydrogenase ； phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase ； phosphoribosyl-ATP pyrophosphohydrolase ； Phaeosphaeria nodorum