冠狀動脈疾病主要是膽固醇和鈣質的堆積所造成的,由於容易導致心肌缺氧和引發心絞痛,且可能會使飛行員失能和猝死於座艙,故常被列為停飛的原因。 國內外皆曾經發生過民航機師在飛航中發病的個案,有的甚至釀成災難。這種血管性的疾病與生活型式有關,戒菸、忌食高脂、高膽固醇和高鹽的食物、多吃蔬果、勤於運動等皆有助於預防。 如今,藥物和心臟血管的外科手術皆可有效地治療冠狀動脈疾病,而許多醫事技術包括電腦斷層、繞道手術、安裝支架和血管造形等,也用在臨床上的病情評估和治療,惟FAA比較偏向於一般性的檢查。冠狀動脈疾病也可能發生過去沒有症狀的患者,一旦發作必須立刻就醫,以免心肌發生繼發性的傷害。