歷來對於東林學派抨擊王學流弊之論點已多有探討,東林學人與劉蕺山、黃宗羲師徒二人在政治上與學問上的密切往來亦是眾所皆知,然而對於他們之間在思想上的關係卻少有人做深入的探討。職此之故,本文乃將焦點放在東林學者孫慎行與劉蕺山兩人思想之異同上,對此做一詳細的分析比較。又,在晚明理學中,劉蕺山思想之重要性已不在話下。至於孫慎行,黃宗羲對其思想的評價則是:「其發先儒所未發者,凡有數端,世說天命者,除理義外,別有一種氣運之命,雜糅不齊,因是則有理義之性,氣質之性,又因是則有理義之心,形氣之心,三者異名而同病。......三者之說,天下浸淫久矣,得先生而雲霧為之一開,真有功于孟子者也。」由此可知,孫慎行思想在理學潮流中是具有特定意義與價值的,本文即以此評價為線索來比較孫慎行與劉蕺山之思想。