親子三元體相關分析在逐次連鎖不平衡檢定方法與逐次概似函數方法之比較

Comparison between Sequential TDT method and Sequential likelihood method in Association Studies using Case-parent triad families

林昆億(Kun-Yi Lin)

指導教授 ： 戴政

國立臺灣大學/公共衛生學院/流行病學研究所/碩士(2007年)

https://doi.org/10.6342/NTU.2007.10468

摘要

本研究使用父、母、染病孩子三元體的資料結構，分別利用統合參數概似函數及傳遞不平衡檢定，來進行連鎖分析。考慮在需要使用逐次過程的情況下，給定特定的疾病基因頻率在不同的遺傳模式下，根據本研究模擬分析顯示，使用結合統合參數概似函數和逐次機率比例檢定(SPRT)的統計量會比結合傳遞不平衡檢定（TDT）和逐次機率比例檢定的統計量到達判定界限所需的樣本數少。

關鍵字

樣本數 ； 逐次機率比例檢定 ； 傳遞不平衡檢定 ； 統合參數概似函數

並列摘要

In this paper, we use case-parent triad families as the data structure to demonstrate how to proceed sequential linkage analysis. We adopt two types of linkage methods, the unified-parameter likelihood method and the transmission/disequilibrium test (TDT) method, to implement this sequential test procedure. Under different genetic scenarios, our simulation studies show that the unified-parameter sequential likelihood method requires less sample sizes to reach the sequential decision boundary than the TDT sequential method.

並列關鍵字

sample size ； sequential probability ratio test ； transmission/disequilibrium test ； unified-parameter likelihood

參考文獻

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