近年來,生物晶片中的基因晶片已經成為生命科學裡重要研究工具,其中又以Affymetrix公司所生產的基因晶片最為常用。由於晶片的製作成本費用高,所以做晶片數據分析時,受限於樣本數太少,資料數不足的困境,藉由Affymetrix晶片資料庫的建立,使得我們有大量的數據,以往的Affymetrix晶片分析,是找出晶片上的顯著基因,但我們有別於顯著基因的發現,目的是找出晶片上特殊表現的基因。 透過統合分析,希望從中找出基因表現的特殊資訊,由於一片晶片上有22283個探針組(基因片段),大部分的探針組亮度分佈呈現單峰,而少部分的探針組亮度分佈為雙峰,對這些雙峰的探針組表現感到興趣,且因為這些基因片段表現量會隨器官的種類不同而異,透過這些少數的雙峰表現基因片段,發展出一套生物顯著指標(BSI),而不需使用整片晶片上的所有探針組的資訊,亦可省去將探針組進一步整合為基因表現的步驟,,即可將器官以及其器官內次種類正確的分類。