於乳酸桿菌屬中找尋細菌素與誘導物的基因並測試其功能

Characterization of Some Bacteriocins and Autoinducer Peptides Identified from Some Lactobacilli

劉政峰(Cheng-Feng Liu)

指導教授 ： 林志侯

國立清華大學/生命科學院/分子醫學研究所/碩士(2010年)

摘要

隨著越來越多的細菌基因體被全定序，透過搜尋資料庫的方法，可以發現有許多基因非常類似細菌素(bacteriocin)或跟細菌素有關的誘導物質(autoinducer peptide，縮寫為AIP)，參考細菌素的一些特性，如帶正電、分子量大小，是否具備GG-motif和序列相似性…等方法，在NCBI、KEGG、PFAM…等資料庫中，找到了七個有可能為細菌素的基因，分別是: SEQ 31、SEQ 34、SEQ 35、SEQ 36、SEQ 17、SEQ 29 and SEQ 30; 此外，還找到一個可能為AIP的基因SEQ 11。除了利用上述方法外，利用分子生物學的方式，如degenerate primer，可以在Lb. rhamnosus TCELL-1中發現AIP。所有找到的基因都利用類似pET-32a載體，pAB，表現，並直接處理和進行細菌素活性測試。這個實驗也使用His-taq 親和性管柱和陽離子交換樹酯去得到更純的胜肽，以避免干擾實驗的準確性。SEQ 11和SEQ 37接著還會進行autoinducing能力測試、生物膜形成。結果發現SEQ 34會抑制Listeria innocua ATCC 33091 、Citrobacter freundii ATCC 8090、Enterococcus faecalis ATCC 19433…等菌的生長; SEQ 11則是另外一個有活性並會殺死Listeria innocua ATCC 33091的胜肽，雖然它一開始被歸類成AIP。而就我們所知，過去鮮少有文獻也是利用搜尋基因的方式去找到新的細菌素。

關鍵字

細菌素 ； 誘導物 ； 乳酸桿菌

並列摘要

無資料

並列關鍵字

bacteriocin ； autoinducer ； lactobacilli

參考文獻

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