DNA甲基化相對機率的估計

The Estimation of Relative Methylation Probabilities Using DNA Methylation Data from NGS

蘇博彥(BO-YAN SU)

指導教授 ： 黃俊宗

國立中正大學/理學院/數學系統計科學研究所/碩士(2015年)

摘要

摘 要

表觀基因組學正在對生物學產生了革命性的影響。這學門的研究對於了解許多疾病的成因是息息相關的。本文將探討其中的一個機制，DNA methylation。
另外，在生物醫療研究中，防治疾病常常是人們最重視的課題，因此近年來成為人類致命疾病之首的癌症，變成了科學家盡心研究預防的重點，而DNA methylation也和癌症有很大的相關性。在本文中提出一個新的統計估計方法First Order Estimator ，此方法對於形成癌症息息相關的relative DNA methylation probability做出一個準確的估計。
我們統計方面的數據是基於NGS(Next Generation Sequencing)實驗得來，而我們提出的方法將有希望幫助科學家更能掌握DNA methylation和癌症的關係。這些關係也許可以為將來防治癌症提供一個正確的方向。
論文將提及另外兩個estimators分別是CCU estimator 和OSU estimator。這兩個估計方法沒有建構統計模型，而First order estimator卻依以一個統計模型去推導而得，因此更合理一些。模擬分析的結果也証實，First Order estimator比CCU和OSU的estimators 在大部份的情況都表現比較好。

關鍵詞：relative DNA methylation probability、NGS(Next Generation Sequencing)、CCU Estimator、OSU Estimator、First Order Estimator。

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並列關鍵字

CCU Estimator ； NGS(Next Generation Sequencing) ； relative DNA methylation probability ； OSU Estimator ； First Order Estimator

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