癌症相關基因分析與代謝網路分析

李崇鴻(Zhong-Hung Lee)

指導教授 ： 張培均

亞洲大學/資訊學院/生物資訊學系碩士班/碩士(2009年)

摘要

摘 要

癌症治療至今為止的大多以化療與手術切除癌細胞為主，而不論何種治療方法對於病患本身都會有所傷害,如化療不只會作用在癌細胞上也會作用在正常細胞上，所以現今大多數研究人員都集中在研究標的治療(Target Treatment)，目的是只針對癌細胞作用而不會傷害到其他正常細胞。因此本研究目的在於提供一個網路工具給研究人員使用，冀望能幫助研究人員在最快的時間內找到癌細胞在人體內的生化代謝途徑，已達到標的治療的目的。

我們利用日本京都大學的KEGG網站裡面所提供的157張生化代謝網路圖為主，讓使用者上傳癌症病患的微陣列資料，本網路工具將利用t-test與fisher-exact test分析其為陣列資料上各個基因的顯著性並將顯著表現的基因對映到生化代謝網路上的酵素代碼(EC number)，同時也將對於各個代謝網路的顯著度以列表方式呈現，並依其p-value的高低排列，在各個代謝圖中會將顯著表現的EC number加註顏色以方便使用者查看並讓使用者方便找到影響癌症的生化代謝網路。

目前因為癌症病患的微陣列資料經過統計計算後所得到的顯著表現基因所能對映到EC Number的數目並不多，在未來是本研究要進行改良的一部份，同時本工具也會隨著日本京都大學的KEGG網站裡生化代謝途徑系統圖的增加而補充本工具的生化代謝系統圖。

關鍵字

代謝網路 ； 微陣列

並列摘要

無資料

並列關鍵字

Pathway ； micrroarray

參考文獻

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