Abstract

Cell-surface heparan sulfate (HS) and its structurally related heparin (HP) play significant roles in a diverse set of biological processes, including cell-cell communication, viral infection, and molecular recognition. However, these materials are not readily available from nature. In this dissertation, we aim to prepare HS/HP oligosaccharides and resolve the difficulties encountered during the synthesis. With the synthesized oligosaccharides, surface plasmon resonance technology would be used to detect the role and relationship of these sugars with other biological molecules.
Chapter 1 initially describes the major components of the cell surface carbohydrates. Structural characterizations as well as biological properties of HP/HS are then discussed to provide a deeper understanding of the relationship between HP and HS. Chapter 2 provides a brief introduction and reviews the literature on the synthesis of heparin octasaccharide or longer sugar chain in recent years. The specific aims and the retro-synthetic plans to address the new preparative routes are illustrated in Chapter 3.
Chapter 4 outlines the construction of even-numbered HP/HS oligosaccharide skeletons from nonreducing end to reducing end, and in particular, the improvements on the reaction pathway. In Chapter 5, the synthesis of odd-numbered fully-protected HP and HS skeleton is detailed. The methodology utilized a linker-attached monosacchatide which was coupled with the even-numbered skeletons to obtain the target compound.
The synthesis of HP/HS di-, tetra-, hex and octasaccharides through an eight-step functional groups transformation of the corresponding sugar skeletons is illustrated in Chapter 6. Chapter 7 presents the attachment of the prepared compounds into a chip together with the investigation of interaction with the proteins FGF1 and HBHA. Strong binding with FGF1 was detected.
The conclusion of our synthetic work is summarized in Chapter 8. Finally, Chapter 9 provides the detailed experimental procedure and the characterization of all new compounds.


摘要
硫酸乙醯肝素(heparan sulfate, HS)與肝素(heparin, HP)是屬於葡胺聚醣(glycosaminoglycan, GAG)的生物分子。到目前為止已經被發現有許多生理反應或病毒的感染皆是透過和硫酸乙醯肝素的鍵結，但是硫酸乙醯肝素在自然界中不容易取得，為研究硫酸乙醯肝素與其他生物分子(例如:病毒、細菌、或生物體重要的蛋白質)間作用的機制。本論文將著重於如何使用化學合成來製備結構確定且成份均勻的硫酸乙醯肝素的寡醣體，再利用電漿表面共振技術，探討其與蛋白質的作用關係。
這篇論文分成九個章節，第一章主要是在描述細胞表面的醣類種類，並將重點著重在描述硫酸乙醯肝素與肝素兩者的結構與生物活性。第二章則次針對近幾年來醣類生物化學家，對有關合成肝素八醣或八醣以上的報導。第三章則是提出我們想要解決的幾個問題及我們想要合成的目標分子，並試著將目標分子進行反合成分析。
第四章描述了如何由非還原端來建構偶數肝素寡醣體的骨架，並且改進合成的路徑。第五章描述了我們對於構成硫酸乙醯肝素與肝素的奇數醣體骨架的的合成工作，在遇到一些問題之後，改由具丙烯基的單醣體骨架配合連結體重新建構單醣，並成功完成骨架建立工作。第六章是描述改變連結單元接上寡醣體骨架以後，經由八個步驟就可以得到硫酸乙醯肝素的雙醣體、四醣體、六醣體以及八醣體。最後，第七章提出了製成硫酸乙醯肝素的醣晶片後，針對於蛋白質FGF1和HBHA測試，並且在與FGF1的偵測中，獲得不錯的結果。
第八章結論中，我們統整了第四到第七章的合成與測試成果。第九章則是提供了在合成工作中所需要的實驗步驟與新產生化合物的詳細物理性質與光譜資料。

目錄

Abstract i
摘要 iii
縮寫對照表 v
中英對照 ix
目錄 xviii
圖索引 xxii
表索引 xxv
流程索引 xxvi
方程式索引 xxviii
第一章 概論肝素和硫酸乙醯肝素 1
1.1 細胞表面的醣共軛分子 1
1.2 肝素與硫酸乙醯肝素的生合成與結構差異 5
1.3 肝素與硫酸乙醯肝素於生理學及蛋白質間的重要性 7
1.4 利用表面電漿共振技術偵測肝素與硫酸乙醯肝素和蛋白質間的生物活性 11
第二章 合成肝素與硫酸乙醯肝素的文獻探討 13
2.1 Bonnaffé 教授之合成工作 13
2.2 Martin-Lomas教授的合成工作 15
2.3 Seeberger教授的合成工作 17
2.4 洪上程教授的合成工作 19
第三章 肝素和硫酸乙醯肝素寡醣體之逆合成分析 23
3.1 合成目標 23
3.2 逆合成分析 24
第四章 肝素與硫酸乙醯肝素偶數醣骨架之建立 28
4.1建構單元雙醣體96之合成 28
4.2建構單元雙醣體96□□之結構鑑定 31
4.3偶數寡醣骨架之合成研究 37
4.3.1 雙醣予體55的合成研究 37
4.3.2 雙醣受體54和99的合成研究 40
4.3.3 寡醣體骨架之建構 42
第五章 肝素與硫酸乙醯肝素奇數醣骨架之建立 47
5.1單醣體80□□之合成 47
5.1.1 將反應步驟向後延伸用以獲得□式單一構型 47
5.1.2 從非還原端合成三醣體並用以與連結體鍵結 49
5.1.3 改變與連結體鍵結反應條件 49
5.1.4 在酸性樹脂催化作用下形成□式化合物 50
5.1.5 化合物115□之合成與探討 52
5.2葡萄胺醣124與新連結體125偶合建立單醣體骨架 53
5.2.1葡萄胺醣124之合成研究 53
5.2.2 醚化生成化合物127的合成研究 55
5.2.3 新連結體135之合成研究 58
5.2.4 □式葡萄胺醣138的合成與鑑定 60
5.3 奇數醣體骨架建立之合成研究 63
5.3.1 奇數醣體的脫酯化反應 64
5.3.2 奇數醣體的氧化反應 66
5.3.3 奇數醣體矽基保護基之移除 69
第六章 轉換連結體並建立肝素與硫酸乙醯肝素之寡醣骨架
72
6.1寡醣體骨架之建立 73
6.1.1 由非還原端鏈結連結體來建構寡醣體骨架 73
6.1.2 由還原端鏈結連結體來建構寡醣體骨架 74
6.2最終產物的合成 77
6.2.1 移除保護基與氧化一級醇 77
6.2.2 移除矽基保護基與氧-磺化反應 78
6.2.3 還原疊氮基與氮-磺化反應，最後氫化形成最終產物 81
6.3最終產物的結構鑑定 83
第七章 肝素與硫酸乙醯肝素與蛋白質的活性檢測 86
7.1生物晶片技術 86
7.2表面電漿共振技術的基本原理 87
7.3表面電漿共振技術的實驗準備 89
7.4 表面電漿共振技術的偵測曲線 90
7.5動力學方式探討蛋白質與肝素寡醣體的作用關係 91
7.6 表面電漿共振技術的實驗方法與注意事項 92
7.7 修飾肝素寡醣體於CM5晶片 93
7.8 蛋白質FGF1和HBHA與肝素寡醣體的作用關係 95
7.8.1 實驗環境的選擇 96
7.8.2 蛋白質FGF1與肝素寡醣體的作用關係和實驗數據的探 討 96
7.8.3 蛋白質HBHA與肝素寡醣體的作用關係和實驗數據的 探討 99
第八章 結論 101
第九章 實驗部分 105
參考文獻 199
附錄 217

參考文獻

(1) Guo, Y.; Feinberg, H.; Conroy, E.; Mitchell, D. A.; Alvarez, R.; Blixt, O.; Taylor, M. E.; Weis, W. I.; Drickamer, K. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 591-598.
(2) Ganesh, V. K.; Smith, S. A.; Kotwal, G. J.; Murthy, K. H. M. P Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 8924-8929.
(3) Liu, J.; Shriver, Z.; Pope, R. M.; Thorp, S. C.; Duncan, M. B.; Copeland, R. J.; Raska, C. S.; Yoshida, K.; Eisenberg, R. J.; Cohen, G.; Linhardt, R. J.; Sasisekharan, R. J. Biol. Chem. 2002, 277, 33456-33467.
(4) Nikitovic, D.; Assouti, M.; Sifaki, M.; Katonis, P.; Krasagakis, K.; Karamanos, N. K.; Tzanakakis, G. N. Int J. Biochem Cell B 2008, 40, 72-83.
(5) Mahdavi, J.; Sonden, B.; Hurtig, M.; Olfat, F. O.; Forsberg, L.; Roche, N.; Angstrom, J.; Larsson, T.; Teneberg, S.; Karlsson, K. A.; Altraia, S.; Wadstrom, T.; Kersulyte, D.; Berg, D. E.; Dubois, A.; Petersson, C.; Magnusson, K. E.; Norberg, T.; Lindh, F.; Lundskog, B. B.; Arnqvist, A.; Hammarstrom, L.; Boren, T. Science 2002, 297, 573-578.
(6) Miller, S. I.; Ernst, R. K.; Bader, M. W. Nat Rev Microbiol 2005, 3, 36-46.
(7) Karlsson, K. A. Biochem Soc T 1999, 27, 471-474.
(8) Crocker, P. R. Curr. Opin. Struc. Biol. 2002, 12, 609-615.
(9) Cooper, D. N. W.; Barondes, S. H. J. Cell. Biol. 1990, 110, 1681-1691.
(10) Hakomori, S.; Igarashi, Y. J .Biochem-Tokyo 1995, 118, 1091-1103.
(11) Fuster, M. M.; Esko, J. D. Rev .Cancer. 2005, 5, 526-542.
(12) Englund, P. T. Annu. Rev. Biochem. 1993, 62, 121-138.
(13) Kornfeld, R.; Kornfeld, S. Annu .Rev .Biochem. 1985, 54, 631-664.
(14) Rosner, M. R.; Hubbard, S. C.; Ivatt, R. J.; Robbins, P. W. Method. Enzymol. 1982, 83, 399-408.
(15) Strous, G. J.; Dekker, J. Crit Rev. Biochem. Mol. 1992, 27, 57-92.
(16) Strous, G. J. A. M. Proc. Natl .Acad .Sci. 1979, 76, 2694-2698.
(17) Varki, A. P.; Baum, L. G.; Bellis, S. L.; Cummings, R. D.; Esko, J. D.; Hart, G. W.; Linhardt, R. J.; Lowe, J. B.; McEver, R. P.; Srivastava, A.; Sarkar, R. Glycobiology 2008, 18, 747-749.
(18) Capila, I.; Linhardt, R. J. Angew. Chem. Int. Ed. 2002, 41, 391-412.
(19) Linhardt, R. J. J. Med. Chem. 2003, 46, 2551-2564.
(20) Whitelock, J. M.; Iozzo, R. V. Chem. Rev. 2005, 105, 2745-2764.
(21) Schaefer, L.; Schaefer, R. M. Cell. Tissue. Res. 2010, 339, 237-246.
(22) Kjellen, L.; Lindahl, U. Annu. Rev. Biochem. 1991, 60, 443-475.
(23) Karst, N. A.; Linhardt, R. J. Curr. Med.Chem. 2003, 10, 1993-2031.
(24) Rabenstein, D. L. Nat. Prod. Rep. 2002, 19, 312-331.
(25) Sugahara, K.; Kitagawa, H. Curr. Opin. Struc. Biol. 2000, 10, 518-527.
(26) Esko, J. D.; Lindahl, U. J. Clin. Invest. 2001, 108, 169-173.
(27) Hacker, U.; Nybakken, K.; Perrimon, N. Nat. Rev. Mol. Cell. Bio. 2005, 6, 530-541.
(28) Hwang, H. Y.; Olson, S. K.; Esko, J. D.; Horvitz, H. R. Nature 2003, 423, 439-443.
(29) Kobayashi, M.; Habuchi, H.; Habuchi, O.; Saito, M.; Kimata, K. J. Biol. Chem. 1996, 271, 7645-7653.
(30) Rong, J. H.; Habuchi, H.; Kimata, K.; Lindahl, U.; Kusche-Gullberg, M. Biochemistry 2001, 40, 5548-5555.
(31) Smeds, E.; Habuchi, H.; Do, A. T.; Hjertson, E.; Grundberg, H.; Kimata, K.; Lindahl, U.; Kusche-Gullberg, M. Biochem. J. 2003, 372, 371-380.
(32) Liu, J.; Shworak, N. W.; Fritze, L. M. S.; Edelberg, J. M.; Rosenberg, R. D. J. Biol. Chem. 1996, 271, 27072-27082.
(33) Shworak, N. W.; Liu, J.; Fritze, L. M. S.; Schwartz, J. J.; Zhang, L. J.; Logeart, D.; Rosenberg, R. D. J. Biol. Chem. 1997, 272, 28008-28019.
(34) Choay, J.; Petitou, M. Med. J. Australia 1986, 144, Hs7-Hs10.
(35) Sinay, P. Nature 1999, 398, 377-378.
(36) Petitou, M.; Herault, L. P.; Bernat, A.; Driguez, P. A.; Duchaussoy, P.; Lormeau, J. C.; Herbert, J. M. Nature 1999, 398, 417-422.
(37) Petitou, M.; Imberty, A.; Duchaussoy, P.; Driguez, P. A.; Ceccato, M. L.; Gourvenec, F.; Sizun, P.; Herault, J. P.; Perez, S.; Herbert, J. M. Chem. Eur. J. 2001, 7, 858-873.
(38) Poletti, L.; Lay, L. Eur. J. Org. Chem. 2003, 2999-3024.
(39) Mulloy, B.; Forster, M. J. Glycobiology 2000, 10, 1147-1156.
(40) Stringer, S. E.; Gallagher, J. T. Int J. Biochem. Cell B 1997, 29, 709-714.
(41) Bishop, J. R.; Schuksz, M.; Esko, J. D. Nature 2007, 446, 1030-1037.
(42) Kronenberg, H. M. Nature 2003, 423, 332-336.
(43) Parish, C. R. Nat. Rev. Immunol 2006, 6, 633-643.
(44) Liu, J.; Thorp, S. C. Med. Res. Rev. 2002, 22, 1-25.
(45) Herbert, J. M.; Petitou, M.; Lormeau, J. C.; Cariou, R.; Necciari, J.; Magnani, H. N.; Zandberg, P.; vanAmsterdam, R. G. M.; vanBoeckel, C. A. A.; Meuleman, D. G. Cardiovasc Drug Rev. 1997, 15, 1-26.
(46) Olson, S. T.; Shore, J. D. J. Biol.Chem.1981, 256, 1065-1072
(47) Petitou, M.; Duchaussoy, P.; Jaurand, G.; Gourvenec, F.; Lederman, I.; Strassel, J. M.; Barzu, T.; Crepon, B.; Herault, J. P.; Lormeau, J. C.; Bernat, A.; Herbert, J. M. J. Med. Chem. 1997, 40, 1600-1607.
(48) Koshida, S.; Suda, Y.; Sobel, M.; Ormsby, J.; Kusumoto, S. Bioorg. Med. Chem. Let. 1999, 9, 3127-3132.
(49) Iacomini, M.; Casu, B.; Guerrini, M.; Naggi, A.; Pirola, A.; Torri, G. Anal. Biochem. 1999, 274, 50-58.
(50) Codee, J. D. C.; van der Marel, G. A.; van Boeckel, C. A. A.; van Boom, J. H. Eur. J. Org. Chem. 2002, 3954-3965.
(51) Petitou, M.; van Boeckel, C. A. A. Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 3118-3133.
(52) Codee, J. D. C.; Stubba, B.; Schiattarella, M.; Overkleeft, H. S.; van Boeckel, C. A. A.; van Boom, J. H.; van der Marel, G. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3767-3773.
(53) Chen, C.; Yu, B. A. Bioorg. Med. Chem. Let. 2009, 19, 3875-3879.
(54) Vlodavsky, I.; Friedmann, Y.; Elkin, M.; Aingorn, H.; Atzmon, R.; Ishai-Michaeli, R.; Bitan, M.; Pappo, O.; Peretz, T.; Michal, I.; Spector, L.; Pecker, I. Nat. Med. 1999, 5, 793-802.
(55) Lai, J. P.; Chien, J.; Staub, J.; Avula, R.; Greene, E. L.; Matthews, T. A.; Smith, D. I.; Kaufmann, S. H.; Roberts, L. R.; Shridhar, V. J. Biol. Chem. 2003, 278, 23107-23117.
(56) Liu, D. F.; Shriver, Z.; Venkataraman, G.; El Shabrawi, Y.; Sasisekharan, R. Pro. Natl. Acad. Sci. 2002, 99, 568-573.
(57) Iozzo, R. V.; San Antonio, J. D. J. Clin. Invest. 2001, 108, 349-355.
(58) Itoh, N.; Ornitz, D. M. Trends. Genet. 2004, 20, 563-569.
(59) Faham, S.; Hileman, R. E.; Fromm, J. R.; Linhardt, R. J.; Rees, D. C. Science 1996, 271, 1116-1120.
(60) Kreuger, J.; Salmivirta, M.; Sturiale, L.; Gimenez-Gallego, G.; Lindahl, U. J. Biol. Chem. 2001, 276, 30744-30752.
(61) Walker, A.; Turnbull, J. E.; Gallagher, J. T. J. Biol. Chem. 1994, 269, 931-935.
(62) Lyon, M.; Deakin, J. A.; Rahmoune, H.; Fernig, D. G.; Nakamura, T.; Gallagher, J. T. J. Biol. Chem.1998, 273, 271-278.
(63) Guimond, S.; Maccarana, M.; Olwin, B. B.; Lindahl, U.; Rapraeger, A. C. J. Biol.Chem. 1993, 268, 23906-23914.
(64) Ishihara, M.; Shaklee, P. N.; Yang, Z. C.; Liang, W. S.; Wei, Z.; Stack, R. J.; Holme, K. Glycobiology 1994, 4, 451-458.
(65) Ornitz, D. M.; Herr, A. B.; Nilsson, M.; Westman, J.; Svahn, C. M.; Waksman, G. Science 1995, 268, 432-436.
(66) DiGabriele, A. D.; Lax, I.; Chen, D. I.; Svahn, C. M.; Jaye, M.; Schlessinger, J.; Hendrickson, W. A. Nature 1998, 393, 812-817.
(67) Plotnikov, A. N.; Schlessinger, J.; Hubbard, S. R.; Mohammadi, M. Cell 1999, 98, 641-650.
(68) Schlessinger, J.; Plotnikov, A. N.; Ibrahimi, O. A.; Eliseenkova, A. V.; Yeh, B. K.; Yayon, A.; Linhardt, R. J.; Mohammadi, M. Mol. Cell. 2000, 6, 743-750.
(69) Stauber, D. J.; DiGabriele, A. D.; Hendrickson, W. A. Pro. Natl. Acad. Sci . 2000, 97, 49-54.
(70) Pellegrini, L.; Burke, D. F.; von Delft, F.; Mulloy, B.; Blundell, T. L. Nature 2000, 407, 1029-1034.
(71) Ye, S.; Luo, Y. D.; Lu, W. Q.; Jones, R. B.; Linhardt, R. J.; Capila, I.; Toida, T.; Kan, M.; Pelletier, H.; McKeehan, W. L. Biochemistry 2001, 40, 14429-14439.
(72) Kwan, C. P.; Venkataraman, G.; Shriver, Z.; Raman, R.; Liu, D. F.; Qi, Y. W.; Varticovski, L.; Sasisekharan, R. J. Biol. Chem. 2001, 276, 23421-23429.
(73) Ostrovsky, O.; Berman, B.; Gallagher, J.; Mulloy, B.; Fernig, D. G.; Delehedde, M.; Ron, D. J. Biol. Chem. 2002, 277, 2444-2453.
(74) Yamada, K. M.; Even-Ram, S. Nat. Cell. Biol. 2002, 4, 75-76.
(75) Allen, B. L.; Rapraeger, A. C. J. Cell. Biol. 2003, 163, 637-648.
(76) Angulo, J.; Ojeda, R.; de Paz, J. L.; Lucas, R.; Nieto, P. M.; Lozano, R. M.; Redondo-Horcajo, M.; Gimenez-Gallego, G.; Martin-Lomas, M. Chembiochem. 2004, 5, 55-61.
(77) Patel, V. N.; Likar, K. M.; Zisman-Rozen, S.; Cowherd, S. N.; Lassiter, K. S.; Sher, I.; Yates, E. A.; Turnbull, J. E.; Ron, D.; Hoffman, M. P. J. Biol. Chem. 2008, 283, 9308-9317.
(78) Liu, L. G.; Bytheway, I.; Karoli, T.; Fairweather, J. K.; Cochran, S.; Li, C. P.; Ferro, V. Bioorg. Med. Chem. Let. 2008, 18, 344-349.
(79) Lee, J. S.; Bae, J. W.; Joung, Y. K.; Lee, S. J.; Han, D. K.; Park, K. D. Int. J. Pharm. 2008, 346, 57-63.
(80) Copeland, R.; Balasubramaniam, A.; Tiwari, V.; Zhang, F. M.; Bridges, A.; Linhardt, R. J.; Shukla, D.; Liu, J. Biochemistry 2008, 47, 5774-5783.
(81) Modis, Y.; Ogata, S.; Clements, D.; Harrison, S. C. Nature 2004, 427, 313-319.
(82) Garson, J. A.; Lubach, D.; Passas, J.; Whitby, K.; Grant, P. R. J. Med.Virol. 1999, 57, 238-242.
(83) Klatzmann, D.; Champagne, E.; Chamaret, S.; Gruest, J.; Guetard, D.; Hercend, T.; Gluckman, J. C.; Montagnier, L. Nature 1984, 312, 767-768.
(84) Roderiquez, G.; Oravecz, T.; Yanagishita, M.; Bouhabib, D. C.; Mostowski, H.; Norcross, M. A. J. Virol. 1995, 69, 2233-2239.
(85) Wang, L.; Yang, L.; Debidda, M.; Witte, D.; Zheng, Y. Pro. Natl. Acad. Sci. 2007, 104, 1248-1253.
(86) Akhtar, J.; Shukla, D. FEBS. J. 2009, 276, 7228-7236.
(87) Spear, P. G. Cell Microbiol. 2004, 6, 401-410.
(88) Heldwein, E. E.; Krummenacher, C. Cell. Mol. Life Sci. 2008, 65, 1653-1668.
(89) Shieh, M. T.; Wudunn, D.; Montgomery, R. I.; Esko, J. D.; Spear, P. G. J. Cell. Biol. 1992, 116, 1273-1281.
(90) Herold, B. C.; Wudunn, D.; Soltys, N.; Spear, P. G. J. Virol. 1991, 65, 1090-1098.
(91) Herold, B. C.; Visalli, R. J.; Susmarski, N.; Brandt, C. R.; Spear, P. G. J. Gen. Virol. 1994, 75, 1211-1222.
(92) Laquerre, S.; Anderson, D. B.; Argnani, R.; Glorioso, J. C. J. Virol. 1998, 72, 4940-4949.
(93) Sedy, J. R.; Spear, P. G.; Ware, C. F. Nat. Rev. Immunol. 2008, 8, 861-873.
(94) Noti, C.; de Paz, J. L.; Polito, L.; Seeberger, P. H. Chem. Eur. J. 2006, 12, 8664-8686.
(95) Gavard, O.; Hersant, Y.; Alais, J.; Duverger, V.; Dilhas, A.; Bascou, A.; Bonnaffe, D. Eur. J. Org. Chem. 2003, 3603-3620.
(96) Lubineau, A.; Lortat-Jacob, H.; Gavard, O.; Sarrazin, S.; Bonnaffe, D. Chem. Eur. J. 2004, 10, 4265-4282.
(97) Dilhas, A.; Lucas, R.; Loureiro-Morais, L.; Hersant, Y.; Bonnaffe, D. J. Comb. Chem. 2008, 10, 166-169.
(98) Baleux, F.; Loureiro-Morais, L.; Hersant, Y.; Clayette, P.; Arenzana-Seisdedos, F.; Bonnaffe, D.; Lortat-Jacob, H. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 743-748.
(99) Lucas, R.; Hamza, D.; Lubineau, A.; Bonnaffe, D. Eur. J. Org. Chem. 2004, 2107-2117.
(100) Lubineau, A.; Gavard, O.; Alais, J.; Bonnaffe, D. Tetrahedron Lett. 2000, 41, 307-311.
(101) Dilhas, A.; Bonnaffe, D. Tetrahedron Lett. 2004, 45, 3643-3645.
(102) Dilhas, A.; Bonnaffe, D. Carbohyd. Res. 2003, 338, 681-686.
(103) Ojeda, R.; Angulo, J.; Nieto, P. M.; Martin-Lomas, M. Can. J. Chem. 2002, 80, 917-936.
(104) Lucas, R.; Angulo, J.; Nieto, P. M.; Martin-Lomas, M. Org. Biomol. Chem. 2003, 1, 2253-2266.
(105) de Paz, J. L.; Ojeda, R.; Reichardt, N.; Martin-Lomas, M. Eur. J. Org. Chem. 2003, 3308-3324.
(106) de Paz, J. L.; Angulo, J.; Lassaletta, J. M.; Nieto, P. M.; Redondo-Horcajo, M.; Lozano, R. M.; Gimenez-Gallego, G.; Martin-Lomas, M. Chembiochem. 2001, 2, 673-685.
(107) Ojeda, R.; de Paz, J. L.; Martin-Lomas, M. Chem. Commun. 2003, 2486-2487.
(108) Ojeda, R.; Terenti, O.; de Paz, J. L.; Martin-Lomas, M. Glycoconjugate J. 2004, 21, 179-195.
(109) de Paz, J. L.; Martin-Lomas, M. Eur. J. Org. Chem. 2005, 1849-1858.
(110) Canales, A.; Angulo, J.; Ojeda, R.; Bruix, M.; Fayos, R.; Lozano, R.; Gimenez-Gallego, G.; Martin-Lomas, M.; Nieto, P. M.; Jimenez-Barbero, J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 5778-5779.
(111) Canales, A.; Lozano, R.; Lopez-Mendez, B.; Angulo, J.; Ojeda, R.; Nieto, P. M.; Martin-Lomas, M.; Gimenez-Gallego, G.; Jimenez-Barbero, J. FEBS. J .2006, 273, 4716-4727.
(112) Canales-Mayordomo, A.; Fayos, R.; Angulo, J.; Ojeda, R.; Martin-Pastor, M.; Nieto, P. M.; Martin-Lomas, M.; Lozano, R.; Gimenez-Gallego, G.; Jimenez-Barbero, J. J. Biomol. Nmr. 2006, 35, 225-239.
(113) Orgueira, H. A.; Bartolozzi, A.; Schell, P.; Seeberger, P. H. Angew. Chem. Int .Ed. 2002, 41, 2128-2131.
(114) Orgueira, H. A.; Bartolozzi, A.; Schell, P.; Litjens, R. E. J. N.; Palmacci, E. R.; Seeberger, P. H. Chem.Eur. J .2003, 9, 140-169.
(115) Lohman, G. J. S.; Seeberger, P. H. J. Org. Chem. 2004, 69, 4081-4093.
(116) Schell, P.; Orgueira, H. A.; Roehrig, S.; Seeberger, P. H. Tetrahedron Lett. 2001, 42, 3811-3814.
(117) Adibekian, A.; Bindschadler, P.; Timmer, M. S. M.; Noti, C.; Schutzenmeister, N.; Seeberger, P. H. Chem. Eur. J. 2007, 13, 4510-4522.
(118) Hung, S. C.; Thopate, S. R.; Chi, F. C.; Chang, S. W.; Lee, J. C.; Wang, C. C.; Wen, Y. S. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3153-3154.
(119) Lee, J. C.; Lu, X. A.; Kulkarni, S. S.; Wen, Y. S.; Hung, S. C. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 476-477.
(120) Hung, S. C.; Thopate, S. R.; Puranik, R. Carbohyd. Res. 2001, 331, 369-374.
(121) Hung, S. C.; Thopate, S. R.; Wang, C. C. Carbohyd. Res. 2001, 330, 177-182.
(122) Wang, C. C.; Lee, J. C.; Luo, S. Y.; Kulkarni, S. S.; Huang, Y. W.; Lee, C. C.; Chang, K. L.; Hung, S. C. Nature 2007, 446, 896-899.
(123) Wang, C. C.; Kulkarni, S. S.; Lee, J. C.; Luo, S. Y.; Hung, S. C. Nat. Protoc. 2008, 3, 97-113.
(124) Zhu, X. M.; Schmidt, R. R. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 1900-1934.
(125) Alper, P. B.; Hung, S. C.; Wong, C. H. Tetrahedron Lett. 1996, 37, 6029-6032.
(126) Yan, R. B.; Yang, F.; Wu, Y. F.; Zhang, L. H.; Ye, X. S. Tetrahedron Lett. 2005, 46, 8993-8995.
(127) Vanhijfte, L.; Little, R. D. J. Org. Chem. 1985, 50, 3940-3942.
(128) Jiang, L.; Chan, T. H. Tetrahedron Lett. 1998, 39, 355-358.
(129) Shie, C. R.; Tzeng, Z. H.; Kulkarni, S. S.; Uang, B. J.; Hsu, C. Y.; Hung, S. C. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 1665-1668.
(130) Ishiwata, A.; Munemura, Y.; Ito, Y. Tetrahedron 2008, 64, 92-102.
(131) Benakli, K.; Zha, C. X.; Kerns, R. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9461-9462.
(132) Kerns, R. J.; Zha, C. X.; Benakli, K.; Liang, Y. Z. Tetrahedron Lett. 2003, 44, 8069-8072.
(133) Boysen, M.; Gemma, E.; Lahmann, M.; Oscarson, S. Chem. Commun. 2005, 3044-3046.
(134) Manabe, S.; Ishii, K.; Ito, Y. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10666-10667.
(135) Mensah, E. A.; Nguyen, H. M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 8778.
(136) Park, J.; Kawatkar, S.; Kim, J. H.; Boons, G. J. Org. Lett. 2007, 9, 1959-1962.
(137) Lee, J. C.; Tai, C. A.; Hung, S. C. Tetrahedron Lett. 2002, 43, 851-855.
(138) Kulkarni, S. S.; Hung, S. C. Lett. Org. Chem. 2005, 2, 670-677.
(139) Schmidt, R. R.; Kinzy, W. Adv. Carbohyd. Chem. Bi. 1994, 50, 21-123.
(140) Wright, J. A.; Yu, J. Q.; Spencer, J. B. Tetrahedron Lett. 2001, 42, 4033-4036.
(141) Zalipsky, S. Bioconjugate Chem. 1995, 6, 150-165.
(142) Svedhem, S.; Hollander, C. A.; Shi, J.; Konradsson, P.; Liedberg, B.; Svensson, S. C. T. J. Org. Chem. 2001, 66, 4494-4503.
(143) Aspinall, H. C.; Greeves, N.; Lee, W. M.; McIver, E. G.; Smith, P. M. Tetrahedron Lett. 1997, 38, 4679-4682.
(144) Herrerias, C. I.; Zhang, T. Y.; Li, C. J. Tetrahedron Lett. 2006, 47, 13-17.
(145) van den Bos, L. J.; Codee, J. D. C.; van der Toorn, J. C.; Boltje, T. J.; van Boom, J. H.; Overkleeft, H. S.; van der Marel, G. A. Org. Lett. 2004, 6, 2165-2168.
(146) van den Bos, L. J.; Litjens, R. E. J. N.; van den Berg, R. J. B. H. N.; Overkleeft, H. S.; van der Marel, G. A. Org. Lett. 2005, 7, 2007-2010.
(147) Vesely, J.; Rydner, L.; Oscarson, S. Carbohyd. Res. 2008, 343, 2200-2208.
(148) DeMico, A.; Margarita, R.; Parlanti, L.; Vescovi, A.; Piancatelli, G. J. Org. Chem. 1997, 62, 6974-6977.
(149) Anelli, P. L.; Biffi, C.; Montanari, F.; Quici, S. J. Org. Chem. 1987, 52, 2559-2562.
(150) Corey, E. J.; Venkates.A. J. Am. Chem. Soc.1972, 94, 6190
(151) Ingram, L. J.; Desoky, A.; Ali, A. M.; Taylor, S. D. J. Org. Chem. 2009, 74, 6479-6485.
(152) Ingram, L. J.; Taylor, S. D. Angew Chem. Int. Ed. 2006, 45, 3503-3506.
(153) Lei, P. S.; Duchaussoy, P.; Sizun, P.; Mallet, J. M.; Petitou, M.; Sinay, P. Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 1337-1346.
(154) Zhang, Y. M.; Sinay, P. Carbohyd. Res. 2003, 338, 1793-1795.
(155) Karst, N.; Jacquinet, J. C. Eur. J .Org. Chem. 2002, 815-825.
(156) Fan, R. H.; Achkar, M.; Hernandez-Torres, J. M.; Wei, A. Org. Lett. 2005, 7, 5095-5098.
(157) Karst, N. A.; Islam, T. F.; Linhardt, R. J. Org. Lett. 2003, 5, 4839-4842.
(158) Ke, W. J.; Whitfield, D. M.; Brisson, J. R.; Enright, G.; Jarrell, H. C.; Wu, W. G. Carbohyd. Res. 2005, 340, 355-372.
(159) Tatai, J.; Fugedi, P. Tetrahedron 2008, 64, 9865-9873.
(160) Arungundram, S.; Al-Mafraji, K.; Asong, J.; Leach, F. E.; Amster, I. J.; Venot, A.; Turnbull, J. E.; Boons, G. J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17394-17405.
(161) Bayley, H.; Standring, D. N.; Knowles, J. R. Tetrahedron Lett. 1978, 3633-3634.
(162) Cid, M. B.; Bonilla, J. B.; Alfonso, F.; Martin-Lomas, M. Eur. J. Org. Chem. 2003, 3505-3514.
(163) Smith, E. A.; Thomas, W. D.; Kiessling, L. L.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6140-6148.
(164) Rini, J. M. Annu. Rev. Bioph. Biom. 1995, 24, 551-577.
(165) Chabre, Y. M.; Contino-Pepin, C.; Placide, V.; Shiao, T. C.; Roy, R. J. Org. Chem. 2008, 73, 5602-5605.
(166) Marra, A.; Moni, L.; Pazzi, D.; Corallini, A.; Bridi, D.; Dondoni, A. Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 1396-1409.
(167) Matrosovich, M.; Klenk, H. D. Rev. Med. Virol. 2003, 13, 85-97.
(168) Suda, Y.; Arano, A.; Fukui, Y.; Koshida, S.; Wakao, M.; Nishimura, T.; Kusumoto, S.; Sobel, M. Bioconjugate Chem. 2006, 17, 1125-1135.
(169) Suda, Y.; Wakao, M.; Saito, A.; Ohishi, K.; Kishimoto, Y.; Nishimura, T.; Sobel, M. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 2499-2504.
(170) Suda, Y.; Wijelath, E. S.; Rahman, S.; Namekata, M.; Murray, J.; Nishimura, T.; Mostafavi-Pour, Z.; Patel, Y.; Humphries, M. J.; Sobel, M. Circulation Res.2006, 99, 853-860.
(171) Suda, Y.; Saito, A.; Wakao, M.; Deguchi, H.; Mawatari, A.; Sobel, M. Tetrahedron 2010, 66, 3951-3962.
(172) Schlick, K. H.; Cloninger, M. J. Tetrahedron 2010, 66, 5305-5310.
(173) Seeberger, P. H.; de Paz, J. L.; Moseman, E. A.; Noti, C.; Polito, L.; von Andrian, U. H. Chem. Biol. 2007, 2, 735-744.
(174) Seeberger, P. H.; de Paz, J. L.; Noti, C.; Bohm, F.; Werner, S. Chem. Biol. 2007, 14, 879-887.
(175) Seeberger, P. H.; Hecht, M. L.; Rosental, B.; Horlacher, T.; Hershkovitz, O.; De Paz, J. L.; Noti, C.; Schauer, S.; Porgador, A. J. Prot. Res.2009, 8, 712-720.
(176) Linhardt, R. J.; Zhang, F. M.; Zhang, Z. Q.; Lin, X. F.; Beenken, A.; Eliseenkova, A. V.; Mohammadi, M. Biochemistry 2009, 48, 8379-8386.
(177) Zhang, F. M.; McLellan, J. S.; Ayala, A. M.; Leahy, D. J.; Linhardt, R. J. Biochemistry 2007, 46, 3933-3941.
(178) Wang, Z.; Xu, Y. M.; Yang, B.; Tiruchinapally, G.; Sun, B.; Liu, R. P.; Dulaney, S.; Liu, J. A.; Huang, X. F. Chem. Eur. J. 2010, 16, 8365-8375.
(179) Liu, H. Y.; Geng, M. Y.; Xin, X. L.; Li, F. C.; Zhang, Z. Q.; Li, J.; Ding, J. Glycobiology 2005, 15, 501-510.
(180) Shih, P. C.; Yang, M. S.; Lin, S. C.; Ho, Y.; Hsiao, J. C.; Wang, D. R.; Yu, S. S. F.; Chang, W.; Tzou, D. L. M. J. Biol. Chem. 2009, 284, 36535-36546.
(181) Tang, Q. J.; Su, X. D.; Loh, K. P. J. Colloid Interface Sci. 2007, 315, 99-106.
(182) Sue, S. C.; Lee, W. T.; Tien, S. C.; Lee, S. C.; Yu, J. G.; Wu, W. J.; Wu, W. G.; Huang, T. H. J. Mol. Biol. 2007, 367, 456-472.
(183) Beattie, J.; Phillips, K.; Shand, J. H.; Szymanowska, M.; Flint, D. J.; Allan, G. J. Molecular and Cellular Biochem. 2008, 307, 221-236.
(184) Kim, S. H.; Kiick, K. L. Peptides 2007, 28, 2125-2136.
(185) Park, S.; Lee, M. R.; Shin, I. Bioconjugate Chem. 2009, 20, 155-162.
(186) Liu, Y.; Palma, A. S.; Feizi, T. Biol. Chem. 2009, 390, 647-656.
(187) Shin, I.; Park, S.; Lee, M. R. Chem. Eur. J. 2005, 11, 2894-2901.
(188) Liang, P. H.; Wu, C. Y.; Greenberg, W. A.; Wong, C. H. Curr. Opin. Chem. Biol. 2008, 12, 86-92.
(189) Blixt, O.; Head, S.; Mondala, T.; Scanlan, C.; Alvarez, R.; Bryan, M. C.; Fazio, F.; Calarese, D.; Stevens, J.; Razi, N.; van Die, I.; Burton, D.; Wilson, I. A.; Cummings, R.; Huflejt, M. E.; Bovin, N.; Wong, C. H.; Paulson, J. C. Glycobiology 2004, 14, 1072-1072.
(190) Ko, K. S.; Jaipuri, F. A.; Pohl, N. L. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13162-13163.
(191) Park, S.; Lee, M. R.; Pyo, S. J.; Shin, I. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10794-10795.
(192) Feizi, T.; Chai, W. G. Nat. Rev. Mol. Cell. Bio. 2004, 5, 582-588.
(193) Culf, A. S.; Cuperlovic-Culf, M.; Ouellette, R. J. Omics 2006, 10, 289-310.
(194) de Paz, J. L.; Seeberger, P. H. Qsar. Comb. Sci. 2006, 25, 1027-1032.
(195) Myszka, D. G. Curr. Opin. Biotech. 1997, 8, 50-57.
(196) Nagaoka, H.; Imae, T. J Colloid Interface Sci. 2003, 264, 335-342.
(197) Zanetti, S.; Bua, A.; Delogu, G.; Pusceddu, C.; Mura, M.; Saba, F.; Pirina, P.; Garzelli, C.; Vertuccio, C.; Sechi, L. A.; Fadda, G. Clin. Diagn. Lab. Immun. 2005, 12, 1135-1138.
(198) Shin, A. R.; Lee, K. S.; Lee, J. S.; Kim, S. Y.; Song, C. H.; Jung, S. B.; Yang, C. S.; Jo, E. K.; Park, J. K.; Paik, T. H.; Kim, H. J. Clin. Vaccine. Immunol. 2006, 13, 869-875.
(199) de Lima, C. S.; Marques, M. A. M.; Debrie, A. S.; Almeida, E. C. C.; Silva, C. A. M.; Brennan, P. J.; Sarno, E. N.; Menozzi, F. D.; Pessolani, M. C. V. Fems. Microbiol. Lett. 2009, 292, 162-169.
(200) Delogu, G.; Bua, A.; Pusceddu, C.; Parra, M.; Fadda, G.; Brennan, M. J.; Zanetti, S. Fems. Microbiol. Lett. 2004, 239, 33-39.
(201) Host, H.; Drobecq, H.; Locht, C.; Menozzi, F. D. Fems. Microbiol. Lett. 2007, 268, 144-150.
(202) Delogu, G.; Brennan, M. J. J. Bacteriol. 1999, 181, 7464-7469.
(203) Esposito, C.; Pethoukov, M. V.; Svergun, D. I.; Ruggiero, A.; Pedone, C.; Pedone, E.; Berisio, R. J. Bacteriol. 2008, 190, 4749-4753.
(204) Menozzi, F. D.; Rouse, J. H.; Alavi, M.; LaudeSharp, M.; Muller, J.; Bischoff, R.; Brennan, M. J.; Locht, C. J. Exp. Med. 1996, 184, 993-1001.
(205) Singh, K. K.; Sharma, N.; Vargas, D.; Liu, Z. T.; Belisle, J. T.; Potharaju, V.; Wanchu, A.; Behera, D.; Laal, S. J. Infect. Dis. 2009, 200, 571-581.
(206) Nguyen, H. M.; Poole, J. L.; Gin, D. Y. Angew Chem. Int. Ed. 2001, 40, 414-417.