中山醫學大學生物醫學科學學系碩士班學位論文
中山醫學大學,正常發行
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在脊椎動物中，蛋白質精胺酸甲基轉移酶 (protein arginine methyltransferase； PRMT) PRMT8 與 PRMT1序列有很高的同源性，主要差異在蛋白質 N 端的部位。PRMT8 是 PRMTs家族中唯一成員具有組織特異性，只表現在腦和神經細胞中。然而 PRMT8 N 端序列在人類和斑馬魚卻不盡相同，在人類富含有獨特的脯胺酸序列，斑馬魚則具有富含麩醯胺酸序列，以及富含脯胺酸和組胺酸的區域。因此我們想進一步探討 PRMT8 N端的功能，並且分析PRMT8 N端在不同物種間的結合蛋白。我們利用酵母雙雜交實驗 (yeast two-hybrid screen; Y2H)，以PRMT8 N端的序列為誘餌來針對成年人類腦部 cDNA 基因庫進行分析，鑑定出10個新的PRMT8 N端特異性的結合蛋白，這些結合蛋白分別與細胞黏著、細胞代謝過程、RNA 結合，轉錄調控、肌動蛋白絲結合、有絲分裂紡錘體的組成和衰老相關。之後也使用藥物3-AT系列性稀釋分析來檢查結合蛋白之間結合的強弱。在跨物種中的分析，也發現到 SDHB 和 TMEFF2 這兩個人類 PRMT8 N 端 (H8N) 的結合蛋白，同時會與斑馬魚PRMT8 N 端（ZF8N）相互結合。當斑馬魚 PRMT8 富含麩醯胺酸的區域被踢除時，DCTN6 和 CACYBP這兩個 H8N 的結合蛋白，就可與 ZF8N 結合。我們也確定了 H8N 與 SDHB 的結合區是在 C 端的134個氨基酸。此外我們也利用共免疫沉澱法來驗證細胞內 H8N 與結合蛋白 (例如: SYNE1、CACYBP和CRIP1a) 之間的結合作用。在本篇研究中，最後我們也使用特異性結合實驗、酵母雙雜交實驗和共免疫沉澱法等，來研究過去曾鑑定出的ZF8N和其結合蛋白 (包含 Epd、ZFYwhaba、INA、actin、 tubulin 和 GAPDH) 的相互作用。由本篇研究結果中，發現了 PRMT8 的結合蛋白，並且對於PRMT8的功能有更具體的了解。
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前言 乳房攝影為臨床上偵測乳癌的一項重要檢查，近年來常使用全景式乳房攝影(full-field digital mammography, FFDM)與數位式乳房斷層攝影(digital breast tomosynthesis, DBT)技術進行乳篩。目前臨床上常用之乳房假體多為剛體結構(rigid construction)，其並不能呈現乳房壓迫時所導致的形變。先前的研究已對Bolus假體之厚度量測與影像品質進行探討，而本研究之目的為評估Bolus軟性材質乳房假體經全景式乳房攝影與數位式乳房斷層攝影之劑量分布情形。 材料與方法 本研究以層狀Bolus假體作為可壓迫假體進行實驗，以兩種攝影系統(Siemens Novation DR and Hologic Selenia Dimensions)進行攝影。在劑量部分，我們使用TLD-100H (LiF：Mg, Cu, P) 進行量測，並以Harshaw 3500型 TLD計讀儀器進行計讀。在空間與環境劑量方面，將TLD-100H黏貼於攝影空間中離地面90、120、140 cm處，分別模擬性腺、乳房與甲狀腺位置。在探討Bolus假體劑量方面，將TLD置於Bolus假體(2-8 cm)表面與不同深度間，使用FFDM與DBT系統搭配不同靶/濾片組合(Mo/Mo、Mo/Rh、W/Rh、W/Ag、W/Al)進行攝影，以評估回散射因子(backscatter factor, BSF)與深部劑量分布。隨後評估每次攝影條件計算之AGD與不同厚度Bolus假體中央層量測劑量，求得AGD之轉換因子，其定義為Bolus中央層量測劑量與AGD之比值。在臨床應用部分，將TLD置於不同厚度之Bolus假體(2、4、6、8 cm)中央層，使用固定式與彈性式壓迫板搭配不同壓迫力(78.3, 117.4與156.6 N)，以自動曝露控制模式(auto exposure control mode)進行攝影，並使用先前求得之AGD轉換因子評估Bolus假體之AGD。 結果與討論 在空間劑量分布方面，結果顯示在乳房位置之量測劑量高於甲狀腺與性腺位置之劑量。在環境劑量分布方面，左右側牆壁之量測劑量(0.828-1.650 mGy)高於前後側牆壁之量測劑量(0.001-0.408 mGy)。BSF方面，Bolus假體之BSF(1.082〜1.122 mGy/mGy)與目前常用乳房假體材質(PMMA，BR-12，BR-fat)的BSF(1.006-1.102 mGy/mGy)非常接近，且在歐洲規範之建議值範圍內(1.07-1.13 mGy/mGy)。在深部劑量方面，不同厚度Bolus假體(2-8 cm)之量測劑量隨假體厚度增加而下降。以FFDM模式攝影時，Bolus假體中央層之量測劑量分別為0.51±0.01、0.65±0.01、0.70±0.01、1.39±0.001、2.02±0.04、1.95±0.03與1.99±0.05 mGy；以Tomo模式攝影時，中央層之量測劑量分別為1.20±0.02、1.22±0.04、1.55±0.03、1.78±0.001、2.38±0.03、3.10±0.03以及3.63±0.02 mGy。結果顯示以Tomo模式攝影時，Bolus假體接收之AGD較FFDM模式攝影之AGD高。在AGD轉換因子方面，結果顯示以FFDM模式攝影時，AGD轉換因子隨Bolus假體厚度增加而上升(0.89-1.18 mGy/mGy)；但以Tomo模式攝影時，AGD轉換因子則隨Bolus假體厚度增加而下降(0.78-0.90 mGy/mGy)。而在臨床應用方面，結果呈現TLD量測劑量(1.24-3.09 mGy)高於計算AGD(1.06-2.93 mGy)。使用彈性式與固定式壓迫板攝影時，AGD預測值與計算值之平均誤差分別為-8±7 %與4±12 %。 結論 在空間劑量分布方面，乳房位置之散射劑量高於甲狀腺與性腺位置。而在環境劑量分布方面，左右方向具有較高之散射劑量。在BSF部分，結果顯示Bolus假體之BSF與常用之硬質假體相似，此結果代表Bolus假體適合用於評估乳房攝影劑量。在AGD轉換係數方面，結果表示能夠以Bolus假體中央層之量測劑量評估AGD。在臨床應用中，TLD並沒有在壓迫的過程中損壞。由此可知，Bolus假體搭配TLD適合在臨床乳房攝影壓迫過程中用於劑量分布之量測。
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前言 近年來評估數位式乳房斷層攝影(digital breast tomosynthesis, DBT)、全景式乳房攝影(full-field digital mammography, FFDM)與重組合成乳房影像(synthesized mammogram, SM)之平均乳腺劑量(average glandular dose, AGD)和影像品質是一項熱門的臨床議題，臨床上是以硬質假體評估平均乳腺劑量與影像品質，本研究目的是應用可壓迫假體評估數位式乳房斷層攝影之平均乳腺劑量及影像品質。 材料與方法 本研究以軟質地Bolus材質設計可壓迫假體進行實驗，使用Mammomat Novation DR (SIEMENS)與Selenia Dimensions (Hologic)進行攝影。首先在厚度評估方面，以Bolus假體搭配放射治療劑量評估軟體(Doselab)建立數位影像為基礎的厚度評估方法(imaged-based breast thickness determination, IBBTD) method，用以修正系統顯示厚度(system indicated thickness, SIT)。其次進行劑量評估，將Bolus堆疊成不同厚度(20~80 mm)，以COMOBO模式進行左右乳房頭腳向(craniocaudal view, CC view)與內外斜位向(mediolateral oblique view, MLO view)攝影，再依歐洲規範計算one-view (MLO) DBT與two-view (CC與MLO) FFDM的AGD。接著進行影像品質評估，將不同大小之Testing objecting (0.127, 0.28與0.5 mm)包埋在不同厚度之Bolus(30, 60與90 mm)之上、中、下層，攝影後得到FFDM、SM與DBT之影像，由9位乳房攝影從業人員依據5分量表(5-steps-scale)進行閱片評分，以分析其總分、敏感性與準確度，以比較FFDM、SM與DBT之影像品質。 結果 在厚度評估方面，IBBTD法最大的厚度評估誤差為-2.4 mm (22.6-25)，小於品保測試規範中之厚度容許誤差±5 mm。在劑量評估方面，one-view DBT的AGD都比FFDM為低；舉例而言，在Bolus假體厚度為60 mm時，one-view DBT的AGD為1.49 mGy而two-view FFDM的AGD為2.75 mGy。在影像品質評估方面，DBT的上層與下層之影像評分沒有顯著差異(p>0.93)。在相同影像種類時，針對不同Testing object size而言，總分、敏感性與準確度都會隨著Testing object大小增加而上升；同時隨著假體厚度增加而下降。在比較FFDM與SM之影像品質方面，FFDM的總分 (70~162)比SM (58~148)高；針對相同大小Testing object而言，FFDM與SM之評分差異會隨著假體厚度增加而加大。 結論 Bolus為片狀假體，非常適合用來發展乳房攝影用之可壓迫假體，結果顯示IBBTD方法的誤差是可以接受的並可用來評估二維壓迫厚度之分布。在劑量評估方面，使用one-view (MLO)DBT攝影時可以降低平均乳腺劑量。在影像方面， FFDM之影像品質優於SM，同時Bolus假體厚度會影響閱片者之評分結果。上述假體實驗之結果將有助於日後進一步探討臨床上使用SM影像來降低DBT檢查中需外加FFDM攝影之需求，以達成抑低病患輻射劑量之策略。
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目的：本研究之目的為了解高度近視患者視網膜形變之狀態，並對其照周邊屈光度，找出兩者之間的相關聯性。 方法：受測者為台灣年輕人共35位，年齡介於20至30歲，組別則按照中央屈光度分成正視眼組(+0.50 D至-0.50 D)與高度近視眼組(＜-6.00 D)，兩組受測者之散光度數皆低於1.00 D (＞-1.00 D)。利用開放式自動驗光儀測量其中央屈光度與周邊屈光度，水平周邊屈光度每3度一跳直至鼻側及顳側30度，垂直周邊屈光度3度一跳直至上側9度及下側12度，再使用眼軸測量儀測量眼軸長及磁振造影測量眼球形狀。 結果：研究結果發現正視眼組周邊屈光呈現相對性近視，視網膜形變則是中間較平周邊較陡，周邊屈光與視網膜形變相關性，顳側與鼻側呈現正相關，但未達統計上意義(顳側：Pearson r = 0.224；p = 0.059；鼻側：Pearson r = 0.137；P = 0.250)；上側與下側則呈現負相關，但未達統計上意義(上側：Pearson r = -0.021；P=0.904；下側：Pearson r = -0.009；p = 0.957)。高度近視眼組周邊屈光呈現相對性遠視，視網膜形變則是中間較陡周邊較平，周邊屈光與視網膜形變相關性，顳側與鼻側呈現負相關，且達統計上意義(顳側：Pearson r = -0.459；P＜0.01；鼻側：Pearson r = -0.277；P = 0.011)；上側與下側則呈現負相關，但未達統計上意義(上側：Pearson r = -0.066；P = 0.679；下側：Pearson r = -0.260；P = 0.096)。 結論：結果顯示正視眼組呈現相對周邊近視；高度近視眼呈現相對周邊遠視。高度近視的周邊遠視失焦確實與視網膜形變有相關性，或許可以藉由減少周邊遠視失焦，減緩視網膜形變，以達到控制近視的效果。未來可以利用這樣的分析方式製作符合視網膜形變的矯正鏡片，來控制近視發展。
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本研究旨在探討臺灣視覺功能缺損者生活品質量表之編製暨視覺功能缺損者生活品質。研究方法採問卷調查法，以研究者自編之「臺灣視覺功能缺損者生活品質量表」為研究工具，視覺功能缺損者為研究對象。針對研究對象進行一對一訪談取得正式有效樣本151份，所得資料採描述統計、獨立樣本t考驗、單因子變異數分析、卡方檢定加以處理，歸納本研究結果如下： 一、 視覺功能缺損病患之生活品質現況 視覺功能缺損病患的生活品質在「家庭與社區」向度中受到自主交通工具的使用、陌生環境的適應、生育子女的考量、以及家庭整體收入等因素的影響。 在「學校」向度中，受試者表示沒有問題或能自行使用輔具解決的比例偏高，足見視障教育在視覺功能缺傷病患就學階段的重要性。 在「就業」向度中，選擇無法回答或因困難而放棄的比例高達六至七成，顯示視覺功能缺傷病患在視覺功能退化發生後放棄就業的意向，足見國家勞政對身心障礙者輔導就業的情況不理想。 二、 背景變項與視覺功能缺損病患生活品質的影響 1. 不同性別在視覺功能缺損患者對生活品質在各向度方面的t考驗分析結果顯示，除了在就業向度上男性得分較女性高達顯著差異，在家庭與社區與學校向度上皆無顯著差異。 2. 不同年齡的視覺功能缺損患者對生活品質在各向度的單因子變異數分析結果顯示，在家庭與社區、學校、就業中皆達顯著差異 3. 不同發病年齡的視覺功能缺損患者對生活品質在各向度的單因子變異數分析結果顯示除在家庭與社區中未達顯著差異，在學校、就業中皆達顯著差異 4. 有無身心障礙證明在視覺功能缺損患者對生活品質在各向度方面的t考驗分析結果顯示，除了在就業向度上沒有顯著差異之外，在家庭與社區在學校向度上皆達顯著差異。 三、 生理變項與視覺功能缺損病患生活品質的影響 1. 不同慣用視力的視覺功能缺損患者對生活品質在各向度的單因子變異數分析結果顯示在家庭與社區、在學校、在就業中皆達顯著差異。 2. 不同視野狀態在視覺功能缺損患者對生活品質在各向度方面的t考驗分析結果顯示，在家庭與社區與學校與在就業向度上皆無顯著差異。 3. 不同眼睛疾病在視覺功能缺損患者對生活品質在各向度方面的t考驗分析結果顯示，白內障與其他水晶體疾病患者、糖尿病視網膜病變者在學校向度上患病者達顯著差異，黃斑部病變者在家庭與社區向度上達顯著差異，青光眼的患者在就業向度上達顯著差異，老年性黃斑部病變在學校及就業向度上達顯著差異。 4. 眼睛症狀在視覺功能缺損患者對生活品質在各向度方面，的t考驗分析結果顯示各種眼睛症狀無論在家庭與社區、學校或就業總向度填答得分上皆無顯著差異。 最後根據研究結果研究者提出對社政、勞政單位及病患的建議及未來研究之參考。
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二氫嘧啶水解酵素 (dihydropyrimidinase) 是一個含有後修飾羧化賴氨酸(post-carboxylated lysine) 的雙金屬酵素，可催化dihydrouracil與dihydrothymine變成N-carbamoyl-β-alanine與N-carbamyl-β-aminoisobutyrate，是DNA 鹼基代謝途徑中極重要的酵素，並廣泛存在於各生物間。除了來自於假單胞菌屬(Pseudomonas) 的二氫嘧啶水解酵素是雙套體外，目前已知所有的此酵素皆為四套體。在此研究，我們將來自綠膿桿菌 (Pseudomonas aeruginosa) 的二氫嘧啶水解酵素基因選殖、大量表達於大腸桿菌、純化與結晶、利用分子置換法解出其結晶結構，並上傳至蛋白質結構資料庫 (Protein Data Bank; PDB)。在我們進行初步結晶條件篩選時，發現有兩種主要結晶條件可得到此酵素晶體，分別為10% PEG 8000、100 mM HEPES、200 mM calcium acetate、pH 5.9與28% PEG 6000、100 mM HEPES、200 mM lithium acetate、pH 7.5。然令人意外的是，此兩種晶體除所屬的空間群 (space group) 不同外，其所解出的結構亦分別有四套體 (tetramer) 與雙套體 (dimer) 兩種 (蛋白質結構序號分別為5E5C與5IWV)，引發了我們對此酵素在溶液中是否亦形成有不同的寡聚體狀態 (oligomerization state) 的研究興趣。我們利用膠體過濾層析分析法 (gel filtration) 發現此酵素在不同的酸鹼度下確實存在著不同四級結構的型態，分別為單套體、雙套體與四套體三種。我們比較此兩個不同型態的結晶結構，並根據結構說明了為何假單胞菌屬的二氫嘧啶水解酵素為雙套體而非廣泛認知的四套體。另外，由於在先前的研究中已發現此酵素可能為一好的新型抗生素標靶，我們亦利用此結晶結構與分子對接 (molecular docking) 方式來說明抑制劑如dihydromyricetin對此酵素的分子抑制機制，並希望試圖據此結構進行下一階段的藥物設計優化、建議出更多的潛在候選抗生素藥物供臨床試驗。
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生物資訊學乃係利用電腦來輔助解讀生物資料，然而，只要是利用到電腦的分析方法都無法避免使用程式對資料進行分析運算，但並非所有程式的使用方式皆平易近人。常見的程式使用方式可以分為兩種，一為純粹文字的命令列介面 (Command Line Interface, CLI)，另一個則是圖像使用者介面 (Graphical User Interface, GUI)，前者執行快速、電腦資源消耗較少，但使用上並不直覺，後者使用方便，但消耗較多的電腦資源。本實驗室與亞洲大學王經篤老師實驗室所合作的演化工具，是基於皮爾森相關係數 (Pearson’s correlation coefficient) 與NCBI BLAST的方法，使用方式是在CLI中使用兩組核心程式－NCBI BLAST及PCC-HC。因此，為了方便使用，便以核心程式為中心，進行GUI的開發。成功對核心程式建立GUI、增添對生物序列檢查的副程式以及兩組核心程式的自動化，使得使用上方便許多，降低因生物序列檔案內容錯誤而得到失敗之結果，並將此演化工具更名為 BBRD－BLAST-Based Relative Distance。
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氟甲磺氯黴素 (Florfenicol, FF) 是一種人工合成 amphenicol 類之廣效型抗生素，藉由干擾胜肽轉換酶 (peptidyl transferase) 進行蛋白質轉譯，以達到抑制細菌滋生的目的，常應用於水產、畜牧動物細菌性疾病的預防與治療。民眾若誤食含有 FF 殘留的肉品或蛋類，研究指出 FF 具雄性生殖毒性，可能導致精細胞減少或增加間質細胞癌的風險；萊克多巴胺 (Ractopamine, Rac)，為一種人工合成酚乙醇胺（phenethanolamine）類的乙型感受體 (β-receptor) 興奮劑，能舒緩平滑肌，原本是想研發治療人類的氣喘疾病，由於心臟、脂肪組織及肌肉上也分布有乙型感受體，動物實驗中意外發現可增加老鼠的體重，並增加瘦肉的比例；後來添加在飼料餵食豬隻，促進豬隻的蛋白質合成且加速脂肪轉化分解，所以 Rac 俗稱為瘦肉精的一種。研究指出 Rac 具有心臟毒性，若民眾誤食含有瘦肉精殘留的肉品，可能造成心悸或心律不整等中毒症狀，嚴重更可能導致心肌受損。因此本實驗利用抗體–抗原之間專一性特性，製備抗體以建立一套快速且敏感的檢測方式，並應用於檢測食品中 FF 或是 Rac 含量。本研究利用 FF 及 Rac 和 Succinic anhydride (SH) 進行衍生，並利用 Thin layer chromatography (TLC) 結果確認衍生後產物，衍生產物經 TLC 純化後再接合載體蛋白使其具有免疫原性，之後用於免疫小鼠及紐西蘭大白兔，以產生具專一性抗體。FF 部分，本研究使用 FF-SH(L3)-DCC/NHS-BSA 作為抗原打入小鼠體內，使小鼠產生具 FF 專一性的多株抗體，並藉由此抗體來開發出檢測 FF 的直接競爭型酵素連結免疫分析法 (Competitive direct enzyme-linked immunosorbent assay, cdELISA)，其抑制 50％ 抗體結合至抗原-酵素接合物所需的 FF 濃度 (IC50) 為 3.14 ng/mL，之後取其小鼠脾臟細胞與骨髓瘤細胞融合，最後篩選出融合瘤單株細胞株 (7G81A3)，分泌對 FF 具有專一性的單株抗體，其單株抗體也可和類似物氯黴素 (Chloramphenicol, CAP) 交叉反應，抑制 50％ 抗體結合至抗原-酵素接合物所需 FF 及 CAP 濃度 (IC50) 分別為 3.7 ng/mL 和 32 ng/mL。在 Rac 部分，利用接合不同的載體蛋白質，以多種抗原來免疫紐西蘭大白兔及小鼠，製備出可辨識 Rac 的多株抗體，並用其開發 cdELISA，檢測兔子及小鼠血清的結果 (IC50) 分別為，40.2 ng/mL 和 20.4 ng/mL。其多株抗體也與其他兩種常見瘦肉精，克倫特羅 (Clenbuterol, CLE) 和沙丁胺醇 (Salbutamol, Sal) 有交叉反應，其抑制 50％ 抗體結合至抗原-酵素接合物所需的 CLE 及 Sal 濃度 (IC50) 分別為 187 ng/mL 和 32 ng/mL。由於 ELISA 仍需要在實驗室操作，為了希望能有適合一般大眾及更簡便的檢測方式，因此利用製備出的抗體與奈米金粒子相接合，開發 FF 及 Rac 的快速免疫層析試紙用於檢測 FF 或 Rac，其試紙的最低偵測量分別為 100 ng/mL、1000 ng/mL。本研究已成功利用 FF 單株抗體開發出靈敏並具有高度專一性的 ELISA 以及建立檢測試紙，此外本研究也成功產生對 Rac 具有專一性的多株抗體，並以此抗體開發 ELISA，但目前建立的免疫試紙仍需要改善，使其專一性與靈敏度更加提升，為食安問題更添一份心力，避免民眾受這些抗生素或瘦肉精影響健康。
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目的：主要探討弱視兒童現今眼科弱視訓練是否足夠，透過密集訓練是否能夠縮短弱視的治療時程，及防阻弱視的回退。 方法：研究對象由彰化縣鹿港鎮豐安診所招募15位弱視兒童(8男7女，平均年齡5.79 ± 0.67)，皆為屈光型弱視，無任何眼睛相關疾病，平均分為兩組，一般訓練組(CAM)，使用CAM訓練每週一次，每次90分鐘。密集訓練組(AM) 除了每週一次CAM訓練外，每天再密集訓練90分鐘，直達到總時數20小時為止，針對受試者的視力值變化、Hart Chart秒數變化、反轉鏡(Accommodative facility)秒數變化、立體視(Titmus stereo acuity)變化，進一步進行分析，本研究使用的統計方法為描述性統計、無母數分析。 結果：一般訓練組WO到W3平均視力值改善，弱眼LogMAR 0.1637，強眼LogMAR 0.135，沒有人達到最佳視力值1.0，W3到W5弱眼LogMAR 0.0063，強眼LogMAR 0.0087，沒有人達到最佳視力值1.0。密集訓練組WO到W3平均改善弱眼LogMAR 0.1886，強眼LogMAR 0.1242，有1位兒童達到最佳視力值1.0，W3到W5弱眼增加LogMAR 0.0357，強眼回退LogMAR 0.0171，共2位兒童達到最佳視力值1.0。Hart Chart W0到W3平均秒數，弱眼減少87秒，強眼減少76秒，W3到W5弱眼減少2秒，強眼減少3秒。Accommodative facility W0到W3平均秒數，弱眼減少30秒，強眼減少28秒，W3到W5弱眼多1秒，強眼不變。立體視皆有維持並無退步，立體視第一週，未測量到立體視者1位、400秒角1位、200秒角１位、160秒角1位、100秒角1位、63秒角2位，第五週200秒角1位、63秒角１位、40秒角1位、20秒角4位。 結論：我們發現一般訓練三週的時間，對於弱視兒童是不夠的，透過密集訓練能讓弱視縮短治療時程，培養視知覺能力和立體雙眼視覺，能避免弱視回退，停止密集訓練後，在後測的表現能夠維持或是更好。
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近幾年來許多研究已經發現在histone及其他的蛋白質上的甲基化會參與基因轉錄的調控。蛋白質甲基化為共價性轉譯後修飾由蛋白質精胺酸甲基轉移酶(PRMT)催化完成，在細胞生長、基因表現和訊息傳導調控機制中，扮演很重要的地位。目前已發現多種PRMT受質既包括组蛋白也包括大量的非组蛋白，也知道部分PRMT偏好的結構形式，但對於各類型的PRMT是否有特定專一性或識別特定排序的胺基酸了解甚少。本研究中，我們將利用生物資訊的方法探討序列上蛋白質精胺酸甲基化的位置與周遭結構及各種類PRMT之間的關係。同時我們利用軟體對這些蛋白質序列進行轉譯後修飾的預測，例如磷酸化位點等，再進一步分析這些轉譯後修飾與甲基化之間的關係。根據前人的研究，我們收集了1000多個蛋白精胺酸甲基化的位點，來自於807條人類蛋白質序列。我們利用演化分析軟體BLAST-Based Relative Distance (BBRD)對這些胜肽序列行進行分群，利用這些已分群的胜肽序列找尋有無精胺酸甲基化特定的序列型態(pattern)出現。經過篩選最後選定的21個子群裡，對每一子群使用PRATT軟體找尋conserved patterns，其中有15組能歸納出特定的序列型態，將這些patterns與前人文獻報告已知的PRMT受質，精胺酸甲基化位點序列是否有相符合。磷酸化研究結果顯示將近6成的磷酸化位點在距離甲基化位點10個胺基酸以內，這結果表示存在磷酸化與甲基化相互影響的可能性。PRMT受質之序列專一性分析雖然並沒有明確的指示出哪一pattern為哪一型PRMT的識別的序列，但也表明了這種方法來研究的可能性。