民國八十七年夏天台灣地區爆發腸病毒的流行,曝露出我國在整體病毒監測體系的不完善,衛生署疾病管制局於民國九十一年起建立病原體基因資料庫,逐年收集並且回溯調查腸病毒臨床檢體的基因體與疾病臨床症狀資料,期建立完備的腸病毒監測系統。腸病毒監測網的建立使得防疫單位可以藉由逐年累積的本土腸病毒感染症資料庫,去瞭解不同血清型別的腸病毒在台灣地區的週期變勤情形,充分掌握其流行趨勢。本研究乃利由種系演化樹分析台灣地區2002與2004年未知血清型別腸病毒排行榜首位的CVA4的VP1基因片段,結果只有一種基因型並無法依據病毒株分離時間與分離地區歸類出不同的基因型。 根據疾病管制局腸病毒基因體資料庫的統計,1998年至2004年9月爲止,未知血清型別腸病毒每年的平均比率爲52.9%,本局研究檢驗中心因應此問題,針對近年台灣地區腸病毒群流行株血清型別排行榜中常見的克沙奇病毒CVA2、A3、A4、A5、A6及A10等建置間接免疫螢光染色法的檢測系統,統一各病毒性合約實驗室對未知血清型別腸病毒之檢測模式,縮短檢測時間有助於迅速建立每年腸病毒流行株之趨勢,凝聚臨床檢驗的焦點。腸病毒監測網可以作爲分析不同血清型別的腸病毒因應特殊的地理環境、季節條件産生流行的週期變化及盛行率變化的研究基礎。本研究發現以病毒基因分析而歸類爲HEV-A腸病毒群,近年來在台灣地區流行的病毒株佔最多數。