薏苡具有豐富的營養價值與機能性成分,是我國傳統藥食同源食材之一,為了瞭解不同品種及產地來源的薏苡其萃取成分差異,本研究以二氧化碳超臨界萃取及超音波輔助乙醇萃取方式,比較不同產地來源、不同品種薏苡籽實之HPLC化學指紋圖譜,作為成分特徵與含量比較之依據。結果顯示不同品種薏苡麩皮超臨界萃取的指紋圖譜略有差異,但是乙醇萃取產物在280 nm波長下之HPLC化學指紋圖譜相當接近,薏苡精白後各吸收峰總面積損失85-97%,顯示糙薏苡麩皮含有主要二次代謝物。薏苡素的含量在種殼最高,其次為麩皮,而在精白薏苡中無法檢出薏苡素。本試驗所建立之薏苡籽實化學指紋圖譜,可作為未來比較不同品種與產地薏苡萃取成分比較的依據。