現今台灣學生自治組織的組織架構與運作以「學生政府」 模式為主,而學生政府的形成約可追溯到1980年代末。然而迄今運作逾30個年頭,全台灣各大專院校的學生自治組織,卻面臨許多困境,難以發揮其功能。 本文透過文獻分析法以及對早期與當代的學生自治工作者的半結構式深度訪談進行資料的收集。並以歷史制度主義的觀點分析當今學生政府的發展歷程,認為1980年代末的臺灣追求民主化的社會背景,是學生自治組織轉型與現今類總統制學生政府誕生的關鍵時刻(critical juncture)。訴求普選是當時的一個行動上的選擇,但這樣的選擇進而限縮了後續的制度選擇,走向了學生政府的型態,接著是一個30年的路徑依賴(path dependence)過程。 另外檢視現今學生自治組織以學生政府的制度形態發展至今,在運作上實際所面臨的問題,接著進一步從制度面探討,認為學生自治組織與國家政府有本質上的差異,而與人民團體較為接近。在未來的制度改善方面,則某些部份可以參考工會法的設計,包括理監事制度的組織架構、幹部的保障、財務面的改善以及避免學生自治組織被不當干預可參考工會法中的不當勞動行為規範,都可以是未來學生自治組織制度改革的參考。