《文鏡秘府論》的卷次有二說:(一)天、地、東、西、南、北;(二)天、地、東、南、西、北。根據《文鏡秘府論》天卷「序」所記細目順序、以及作為《文鏡秘府論》略本的《文筆眼心抄》的內容排列順序,特別是筆者在作傳本調查時,從藏于日本應考高山寺的古抄本中找到直接標明卷次的根據,證明《文鏡秘府論》的卷次應該是天、地、東、西、南、北。這就說明,《文鏡秘府論》六卷,不是用對稱的方式,而是用層進的方式展開。更主要的是,中國人的方位觀念是東南西北,而日本人的方位觀念是東西南北,這就說明,空海按照日本人的方位觀念,帶著濃厚的日本意識,來編撰《文鏡秘府論》的。這在文化交流史上,是值得注意的現象。