雄不稔性及柱頭外露率為生產雜交種水稻之重要性狀,本研究目的為選拔兩系雜交種用之稉稻、秈稻雄不稔品系及含有恢復基因的優良品系。本試驗以具溫敏性雄不稔特性之台大品系A與台南13號雜交,並將其F2族群栽種於台大農場溫室以進行性狀調查及遺傳分析。即先以182株F2品系及80組SSR和InDel分子標誌建立連鎖圖譜,並配合外表型資料以多重區間定位法定位數量性狀基因座,所分析的性狀包含溫敏性雄不稔、柱頭外露率、抽穗期、株高、葉鞘顏色、柱頭顏色、稃尖顏色、穗數、穗長和稔實率,依分析結果定位此10個性狀的QTL。本研究初步測定位於第8對染色體上的分子標誌CH0866及SLS188與溫敏性雄不稔基因緊密連鎖;此外,於第3、5、6及12對染色體上定位到調控柱頭外露率的基因;亦於第1對染色體定位到調控葉鞘顏色之基因。高柱頭外露率特性將有助於提高雜交授粉成功率,而葉鞘顏色則可應用於成功雜交苗的選別。本試驗除了初步探討溫敏性雄不稔性狀之遺傳機制外,並依據雄不稔外表型、父本稉稻背景基因型貢獻率及柱頭外露率選拔優良品系,最後推薦5個雄不稔稉稻品系、5個雄不稔秈稻品系及4個可能含有恢復基因之高產品系,供未來兩系雜交稻之研究及育種利用。