大眼鯛(Priacanthus macracanthus)為臺灣漁業經濟魚種之一,由於近年來大量捕撈,已造成產量長期下滑之趨勢。本研究期望藉由生物性標籤探討臺灣周圍海域之大眼鯛系群,進一步達到漁業資源管理之目的。因此首先查明大眼鯛寄生蟲相;其次選擇理想蟲種做為生物性標籤,並將大眼鯛之生理因子包括:魚齡、性別、肝臟指數及生殖腺指數與寄生蟲感染參數進行統計分析,藉此推論臺灣周圍海域之大眼鯛系群。 本研究為首次以寄生蟲做為生物標籤,進行臺灣近海大眼鯛系群區分。自2011年10月至2013年4月,分別由宜蘭縣大溪漁港及屏東縣東港漁港取得臺灣東北及西南海域分布的大眼鯛樣本。而大眼鯛寄生蟲相主要包括12種,分屬於圓形動物、扁形動物、節肢動物等三個動物門。圓形動物門含四種:典型海獸胃線蟲(Anisakis typica)、派氏海獸胃線蟲(Anisakis pegreffii)、有鉤宮脂線蟲(Hysterothylacium aduncum)、帶魚針蛔線蟲(Raphidascaris trichiuri);五種扁形動物複殖吸蟲亞綱:細偽類孔吸蟲(Pseudopecoeloides tenuis)、海南合體雙吸蟲(Syncorpozoum hainanensis)、大眼鯛指腺吸蟲(Lecithochiriump priacanthi)、動殖科吸蟲Dupliciporia lantern、牛首屬吸蟲(Bucephalus sp.);節肢動物門甲殼綱橈足亞綱有兩種:魚虱(Caligus absens)、人形魚虱(Norion priacanthi),軟甲亞綱等足目動物一種:尖甲水虱(Nerocila sp.)。上列寄生蟲有5種為寄主新紀錄,除魚虱、人形魚虱外,其餘皆為為地理新紀錄。再根據感染之盛行率(prevalence)、平均感染強度(mean intensity)與平均豐富度(abundance)之高低等參數,嘗試選擇2種海獸胃線蟲屬圓蟲、有鉤宮脂線蟲、細偽類孔吸蟲、魚虱(Caligus absens)及人形魚虱(Norion priacanthi)作為研究大眼鯛系群之生物性標籤並探討與大眼鯛生理因子之關係。 此外,針對盛行率最高之細偽類孔吸蟲,增幅其ITS-1, 5.8 S以及 ITS-2等核糖體基因,得到1180 bp DNA片段,並將完整5.8 S以及 ITS-2序列與NCBI資料庫數據比對,除了作為鑑定此物種之分子分類依據外,亦有助於解析孔腸科複殖吸蟲之親緣演化。